RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578317.5

COPS3-215, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene COPS3, Length 1,625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-215ENST00000578317 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CALHM2Q9HA72 323 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 INIPQ9NRY2 104 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 LUZP4Q9P127 313 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 U3KQE9 123 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CD8B2A6NJW9 211 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CENPBD1B2RD01 187 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 RNF13O43567 381 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 AHCYL1O43865 530 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 MPZL2O60487 215 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 WDR1O75083 606 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SYNGR4O95473 234 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 IGLV1-40P01703 118 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ACADSP16219 412 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ZNF43P17038 809 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 AHCYP23526 432 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SDHAP31040 664 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 GRK5P34947 590 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CTXN1P60606 82 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CDC42P60953 191 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ISL1P61371 349 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 HSF1Q00613 529 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SRYQ05066 204 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 PGGHGQ32M88 737 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ZNF691Q5VV52 312 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SETD9Q8NE22 299 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 RNF128Q8TEB7 428 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CYGBQ8WWM9 190 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 MUS81Q96NY9 551 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SNX18Q96RF0 628 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 DDOQ99489 341 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 APOL4Q9BPW4 351 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 IFT27Q9BW83 186 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 Q9H521 79 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 BCO1Q9HAY6 547 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CMC2Q9NRP2 79 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 GLRX2Q9NS18 164 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CACNA1BQ00975 2339 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 A0A1W2PRG6 482 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 TMEM82A0PJX8 343 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ZNF716A6NP11 495 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CLCA1A8K7I4 914 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ZNF724A8MTY0 619 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 MCIDASD6RGH6 385 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 GPR171O14626 319 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 SURF4O15260 269 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 FCGR2AP12318 317 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 HLA-DOBP13765 273 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 MYF6P23409 242 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 PCYT1AP49585 367 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 TEKQ02763 1124 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 PON3Q15166 354 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ACKR1Q16570 336 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CASP12Q6UXS9 341 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 FCRLAQ7L513 359 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 UEVLDQ8IX04 471 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 KDM8Q8N371 416 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS3-215ENST00000578317 OR6X1Q8NH79 312 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.6 ms