RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OAFQ86UD1 273 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 WDR31Q8NA23 367 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SYT14Q8NB59 555 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NEUROG1Q92886 237 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FBXW5Q969U6 566 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 THTPAQ9BU02 230 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD19PQ9H560 264 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A087WUU8 490 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 GADD45GO95257 159 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 T-ENOLP0DO92 83 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CD79AP11912 226 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PTAFRP25105 342 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CD40P25942 277 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM11AP58511 58 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PRKCDQ05655 676 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CD47Q08722 323 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 WDFY1Q8IWB7 410 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NOXO1Q8NFA2 376 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OR6X1Q8NH79 312 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM171Q8WVE6 324 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PIGTQ969N2 578 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM15Q9C019 465 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 GLTPQ9NZD2 209 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 LAMP3Q9UQV4 416 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 USF3Q68DE3 2245 aa10.03□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PRQ8 180 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 OR10H3O60404 316 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 PRSS23O95084 383 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 IGF2P01344 180 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 QDPRP09417 244 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 CD53P19397 219 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 RRM2P31350 389 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ACVR1BP36896 505 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC9A3P48764 834 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF84P51523 738 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 CTXN1P60606 82 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 CHRNB3Q05901 458 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 DGCR6Q14129 220 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 FXNQ16595 210 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 MTX3Q5HYI7 312 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ASB10Q8WXI3 467 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ITPKCQ96DU7 683 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 PERPQ96FX8 193 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 C7orf34Q96L11 122 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 LRR1Q96L50 414 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF347Q96SE7 839 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 FOXB1Q99853 325 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 MUC13Q9H3R2 512 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 MGAT4BQ9UQ53 548 aa10.02□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 F8P00451 2351 aa10.01□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 UNC119BA6NIH7 251 aa10.01□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 XKRYO14609 159 aa10.01□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 FARS2O95363 451 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB36O95755 333 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms