RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 COMMD3Q9UBI1 195 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 MED31Q9Y3C7 131 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.61□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 A0A1B0GVI7 797 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 C7orf66A4D0T2 115 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CXCL3P19876 107 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.553e-11■■■■■ 49.9
ATG13-211ENST00000528494 FOLR3P41439 243 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CAPZA2P47755 286 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 PNLIPRP2P54317 469 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ZNF117Q03924 483 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 PCOLCEQ15113 449 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ULK3Q6PHR2 472 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 POGLUT1Q8NBL1 392 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ZNF563Q8TA94 476 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SCMH1Q96GD3 660 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 KCNK7Q9Y2U2 307 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 LRRN3E7EW58 273 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 PDCD5O14737 125 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ZFAND5O76080 213 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 APOC3P02656 99 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 FGF2P09038 288 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 C4BPBP20851 252 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 FPR3P25089 353 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 OTX2P32243 289 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 RAB13P51153 203 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ARHGDIBP52566 201 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SMSP52788 366 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SSTP61278 116 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 OR51A7Q8NH64 312 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SGK3Q96BR1 496 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CXorf58Q96LI9 332 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 MYOTQ9UBF9 498 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 EDARQ9UNE0 448 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 GPR52Q9Y2T5 361 aa11.6□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 MPTX1A8MV57 137 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 PRKYO43930 277 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SELENOFO60613 162 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CDK20Q8IZL9 346 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 BVESQ8NE79 360 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 OR5L2Q8NGL0 311 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 NUBPLQ8TB37 319 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CT55Q8WUE5 264 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SAMD8Q96LT4 415 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SLC38A2Q96QD8 506 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 OR51J1Q9H342 316 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 BIN3Q9NQY0 253 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CLN6Q9NWW5 311 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 AIPO00170 330 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 KLF4O43474 513 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ENTPD6O75354 484 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 WISP1O95388 367 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 COX6A1P12074 109 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 MST1P26927 711 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ADH7P40394 386 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 EVX1P49640 407 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 CDK5Q00535 292 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 GPR176Q14439 515 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 PLA1AQ53H76 456 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 C22orf42Q6IC83 251 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.59□□□□□ -0.55
ATG13-211ENST00000528494 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms