RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516414.1

RNU6-1049P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1049, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1049P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF226Q9NYT6 803 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF492Q9P255 531 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 STK26Q9P289 416 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 XCL2Q9UBD3 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 GNG12Q9UBI6 72 aa-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 S4R3C0 116 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MPDZO75970 2070 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 A0A0U1RQV1 116 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 TMEM120BA0PK00 339 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 BTBD17A6NE02 478 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 GABRR3A8MPY1 467 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TRIM49D1C9J1S8 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 E7EQL1 145 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CLDN34H7C241 214 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 H7C417 338 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 JAK2O60674 1132 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SLC19A2O60779 497 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TBX19O60806 448 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CCDC22O60826 627 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 BBOX1O75936 387 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 DIRAS1O95057 198 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 PTTG1O95997 202 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MT-ATP6P00846 226 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 APCSP02743 223 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MT-ND3P03897 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IGKV1-16P04430 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ASGR1P07306 291 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 CGB7P0DN87 165 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 CD37P11049 281 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IFI30P13284 250 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 NTF3P20783 257 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 LAP3P28838 519 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 NTSP30990 170 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CD70P32970 193 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CD80P33681 288 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 HRH1P35367 487 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 OPRK1P41145 380 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 KIR2DS4P43632 304 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CDKN2DP55273 166 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 DLX1P56177 255 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TAS2R31P59538 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RND3P61587 244 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-1049P-201ENST00000516414 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CDK16Q00536 496 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 HMGCS1Q01581 520 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF92Q03936 586 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MXD1Q05195 221 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TGM3Q08188 693 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 GK3PQ14409 553 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ATP6AP1Q15904 470 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PRSS8Q16651 343 aa-0.05□□□□□ -2.42
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