RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516147.1

RNU6-617P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 617, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-617P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-617P-201ENST00000516147 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 ZNF226Q9NYT6 803 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 ZNF492Q9P255 531 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 STK26Q9P289 416 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 XCL2Q9UBD3 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 GNG12Q9UBI6 72 aa-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 S4R3C0 116 aa-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 A0A0U1RQV1 116 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 A0A1W2PNM2 257 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 TRIM49D1C9J1S8 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 E7EQL1 145 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 CLDN34H7C241 214 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 H7C417 338 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 NBR2O15453 112 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 B4GALT5O43286 388 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 SLC19A2O60779 497 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 TBX19O60806 448 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 CCDC22O60826 627 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 MT-ND3P03897 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 SLC35G4P0C7Q5 338 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 CGB7P0DN87 165 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 CD37P11049 281 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 IFI30P13284 250 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 LAP3P28838 519 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 NTSP30990 170 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 KIR2DS4P43632 304 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 CDKN2DP55273 166 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 DLX1P56177 255 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 TAS2R31P59538 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 RND3P61587 244 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-617P-201ENST00000516147 ZNF92Q03936 586 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 MXD1Q05195 221 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 TGM3Q08188 693 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 GK3PQ14409 553 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 ATP6AP1Q15904 470 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-617P-201ENST00000516147 PRSS8Q16651 343 aa-0.05□□□□□ -2.42
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