RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	ATP5J2	P56134	94 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	PRKCD	Q05655	676 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF566	Q969W8	418 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	NOX3	Q9HBY0	568 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	DIRAS1	O95057	198 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	HLA-H	P01893	362 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	B4GALT1	P15291	398 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	PAX7	P23759	505 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CALCR	P30988	508 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	FABP6	P51161	128 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	VLDLR	P98155	873 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	NAAA	Q02083	359 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	HIST3H3	Q16695	136 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	MDP1	Q86V88	176 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588		Q96MF0	132 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	FOXB1	Q99853	325 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588		V9GYQ6	96 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	NF1	P21359	2839 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A1W2PRG6	482 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	TRIM64B	A6NI03	449 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ARPC2	O15144	300 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	NDUFS7	O75251	213 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	GMNN	O75496	209 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	IGHG1	P01857	330 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	SEMG1	P04279	462 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	QDPR	P09417	244 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CAPZA2	P47755	286 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	MUC15	Q8N387	334 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	SYT14	Q8NB59	555 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	HTRA1	Q92743	480 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	MCHR2	Q969V1	340 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	PYURF	Q96I23	114 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF347	Q96SE7	839 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588		B2RBV5	119 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	CDC42EP2	O14613	210 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	DHH	O43323	396 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ACADS	P16219	412 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SERF1B-208	ENST00000515588	RHCE	P18577	417 aa		13.67	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms