RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NR4A1P22736 598 aa13.11□□□□□ -0.31
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 VLDLRP98155 873 aa13.11□□□□□ -0.31
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.11□□□□□ -0.31
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 hCG_2039718K7EN88 272 aa13.09□□□□□ -0.31
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA21Q7Z572 469 aa13.09□□□□□ -0.31
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 MED31Q9Y3C7 131 aa13.09□□□□□ -0.31
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 LSP1P33241 339 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MDH1P40925 334 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NR4A2P43354 598 aa13.08□□□□□ -0.32
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLRN1P58418 232 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS23P62266 143 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GALK2Q01415 458 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ST3GAL3Q11203 375 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HIST3H3Q16695 136 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYB5R2Q6BCY4 276 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT80Q6KB66 452 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SKA3Q8IX90 412 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SVOPLQ8N434 492 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKS4BQ8N8V4 417 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RCN3Q96D15 328 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TPD52L3Q96J77 140 aa13.08□□□□□ -0.32
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