RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 GIPC3Q8TF64 312 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-212ENST00000508338 ALG12Q9BV10 488 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-212ENST00000508338 DGCR6LQ9BY27 220 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-212ENST00000508338 GRHPRQ9UBQ7 328 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-212ENST00000508338 AMDHD2Q9Y303 409 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-212ENST00000508338 A6NNC1 897 aa23.58■■□□□ 1.37
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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SH3BP2-212ENST00000508338 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVK-25P63136 954 aa23.54■■□□□ 1.36
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SH3BP2-212ENST00000508338 NRN1LQ496H8 165 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM122BQ7Z309 247 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ADCK1Q86TW2 530 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNK17Q96T54 332 aa23.54■■□□□ 1.36
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