RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	GIF	P27352	417 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	THBS4	P35443	961 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SERPINB5	P36952	375 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC1A3	P43003	542 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ETV4	P43268	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CHN2	P52757	468 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CDH15	P55291	814 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	HGFAC	Q04756	655 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NPRL3	Q12980	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NFYC	Q13952	458 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SQLE	Q14534	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CASP8	Q14790	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ADRM1	Q16186	407 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CARM1	Q86X55	608 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	KDM8	Q8N371	416 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TESC	Q96BS2	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SORT1	Q99523	831 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965		B9A039	149 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	FAAH	O00519	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	WNT9B	O14905	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TYROBP	O43914	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	APOL3	O95236	402 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	AGR2	O95994	175 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	BCHE	P06276	602 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ADRA2A	P08913	450 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NR2F1	P10589	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PNMT	P11086	282 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ETFA	P13804	333 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IL7R	P16871	459 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NPR2	P20594	1047 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CXCR1	P25024	350 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IL12A	P29459	219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MVD	P53602	400 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CLDN17	P56750	224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	UFM1	P61960	85 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	VSNL1	P62760	191 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	HOXC5	Q00444	222 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IL1RL1	Q01638	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RIN1	Q13671	783 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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