RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 FZR1Q9UM11 496 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 EFCAB7A8K855 629 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 H0YL77 283 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SLC1A7O00341 560 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SPRY2O43597 315 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CNIH1O95406 144 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TDP2O95551 362 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CRYAAP02489 173 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 RLN2P04090 185 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CST2P09228 141 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 LHCGRP22888 699 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 HRH2P25021 359 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CHATP28329 748 aa6.46□□□□□ -1.38
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PDCD4-211ENST00000498367 GNPDA1P46926 289 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ACVR1Q04771 509 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KLRB1Q12918 225 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 GAGE13Q4V321 117 aa6.46□□□□□ -1.38
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PDCD4-211ENST00000498367 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 MED27Q6P2C8 311 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.46□□□□□ -1.38
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PDCD4-211ENST00000498367 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.46□□□□□ -1.38
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PDCD4-211ENST00000498367 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.46□□□□□ -1.38
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PDCD4-211ENST00000498367 AGPAT1Q99943 283 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 EBF4Q9BQW3 602 aa6.46□□□□□ -1.38
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PDCD4-211ENST00000498367 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KAT6AQ92794 2004 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ASPDHA6ND91 283 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 C17orf105B2RV13 164 aa6.45□□□□□ -1.38
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PDCD4-211ENST00000498367 MPZL1O95297 269 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 NUDT3O95989 172 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 IL18BPO95998 194 aa6.45□□□□□ -1.38
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PDCD4-211ENST00000498367 MMP1P03956 469 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TFPIP10646 304 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ENGP17813 658 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PRKACGP22612 351 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 DDOSTP39656 456 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 RFC3P40938 356 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SULT1A1P50225 295 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SULT1A2P50226 295 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ID2Q02363 134 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SEMG2Q02383 582 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF415Q09FC8 603 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ITPK1Q13572 414 aa6.45□□□□□ -1.38
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