RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ISPD	A4D126	451 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		A8MVM7	634 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		B4DXG7	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		C9J4A7	227 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OGG1	O15527	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T1	O43869	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM127	O75204	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SULT1C4	O75897	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GLCE	O94923	617 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LALBA	P00709	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MT-ND5	P03915	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	COX6A1	P12074	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CD59	P13987	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SPI1	P17947	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCR1	P25024	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX6	P35712	828 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CD79B	P40259	229 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TGM4	P49221	684 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTA2	P62736	377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTG2	P63267	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	E2F1	Q01094	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF85	Q03923	595 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	QPRT	Q15274	297 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPB2	Q16082	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MED20	Q9H944	212 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61

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