RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	NF1	P21359	2839 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	GMNC	A6NCL1	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404		H7C417	338 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	SSX4	O60224	188 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	PIP5K1C	O60331	668 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	UBL3	O95164	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	IGF2	P01344	180 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	IGKV3-15	P01624	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	HLA-H	P01893	362 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	CELA3B	P08861	270 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	FUT1	P19526	365 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	DRD4	P21917	467 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	TNK1	Q13470	666 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	RAB35	Q15286	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	CA10	Q9NS85	328 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	FKBP7	Q9Y680	259 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHMP3-208	ENST00000486404	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.21	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	VSTM5	A8MXK1	200 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF223	E7ERA6	249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NDUFS7	O75251	213 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	F13B	P05160	661 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PGA4	P0DJD7	388 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PGA3	P0DJD8	388 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NR2C1	P13056	603 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	IFI30	P13284	250 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NCK1	P16333	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	AQP2	P41181	271 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF84	P51523	738 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TRAM2	Q15035	370 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	HTRA1	Q92743	480 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM54	Q969K7	222 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RHCG	Q9UBD6	479 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	DCTN3	O75935	186 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PDE5A	O76074	875 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	LY6G6D	O95868	133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	CALCR	P30988	508 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SERPINF1	P36955	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	GIPR	P48546	466 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	GYS2	P54840	703 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	DSCR9	P59020	149 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MXRA7	P84157	204 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	GALK2	Q01415	458 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PIGF	Q07326	219 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NRM	Q8IXM6	262 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NUP37	Q8NFH4	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ASB10	Q8WXI3	467 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404		B9A039	149 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404		J3KTA2	159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	DHH	O43323	396 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	QDPR	P09417	244 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	CSF3	P09919	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	OR4A8	P0C604	315 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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