RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 MEF2DQ14814 521 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 HBMQ6B0K9 141 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 MITD1Q8WV92 249 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC25A28Q96A46 364 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ISOC2Q96AB3 205 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 KIRREL1Q96J84 757 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC35E1Q96K37 410 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 OR5B2Q96R09 309 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNK17Q96T54 332 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 LPAR4Q99677 370 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 MGAT4DA6NG13 374 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 C9JVG2 144 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP5D1E7EU14 171 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 M0R296 226 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ACOT7O00154 380 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 B4GALT5O43286 388 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 DOK2O60496 412 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 STK16O75716 305 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 SCGNO76038 276 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TSPAN15O95858 294 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ARG1P05089 322 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 UMODP07911 640 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 CHRM4P08173 479 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ACRP10323 421 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TDGF1P13385 188 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 PNLIPP16233 465 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 UFM1P61960 85 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF234Q14588 700 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 GINS1Q14691 196 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 UNC50Q53HI1 259 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 XYLT1Q86Y38 959 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 NRMQ8IXM6 262 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 LYG1Q8N1E2 194 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 COMMD1Q8N668 190 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF738Q8NE65 137 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 THEM6Q8WUY1 208 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ERGIC1Q969X5 290 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ARRDC3Q96B67 414 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 SCLYQ96I15 445 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TBX21Q9UL17 535 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 LHX6Q9UPM6 363 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 NEU3Q9UQ49 428 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 RHBDL1O75783 438 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 SLCO2B1O94956 709 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 RAB36O95755 333 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 TOMM40O96008 361 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms