RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 MMEL1Q495T6 779 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 SGO1Q5FBB7 561 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 ARMC3Q5W041 872 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 OR4C11Q6IEV9 310 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM57BQ71RH2 274 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 GSTA5Q7RTV2 222 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 POC5Q8NA72 575 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.35□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 BBS4Q96RK4 519 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 CENPKQ9BS16 269 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 MS4A8Q9BY19 250 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.35□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 MMP26Q9NRE1 261 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 EMC3Q9P0I2 261 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 CMAHPQ9Y471 501 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 A3GALT2U3KPV4 340 aa3.35□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.34□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.34□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAM228BP0C875 321 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 CPMP14384 443 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 ELK4P28324 431 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 NMBRP28336 390 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGEA8P43361 318 aa3.34□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.34□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.34□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf88Q6PI97 169 aa3.34□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 CENPUQ71F23 418 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 NOXA1Q86UR1 476 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 SATL1Q86VE3 508 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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ECHDC1-211ENST00000460558 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 GJC3Q8NFK1 279 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM163Q8TC26 289 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 UPRTQ96BW1 309 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM68Q96MH6 324 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 RCHY1Q96PM5 261 aa3.34□□□□□ -1.87
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.34□□□□□ -1.87
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