RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 ZNF566Q969W8 418 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 GLTPQ9NZD2 209 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 ZNF229Q9UJW7 825 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 SLC7A7Q9UM01 511 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 FARS2O95363 451 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 ZNF23P17027 643 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 GIPRP48546 466 aa13.1□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 NPTX1Q15818 432 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 MMEL1Q495T6 779 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa13.1□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 BAG5Q9UL15 447 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 SYNGR3O43761 229 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 STAMBPO95630 424 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 BCL10O95999 233 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 TGFAP01135 160 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 NPPAP01160 153 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 IFNA14P01570 189 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 ADRA2AP08913 450 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 OR8G3PP0DMU2 310 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 GIFP27352 417 aa13.09□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 CHN2P52757 468 aa13.09□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 UGT2A3Q6UWM9 527 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 CCDC80Q76M96 950 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 HDDC2Q7Z4H3 204 aa13.09□□□□□ -0.31
HERC3-206ENST00000431413 DPPA2Q7Z7J5 298 aa13.09□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 CHODLQ9H9P2 273 aa13.09□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 TAS2R5Q9NYW4 299 aa13.09□□□□□ -0.31
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HERC3-206ENST00000431413 TMEM129A0AVI4 362 aa13.08□□□□□ -0.32
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HERC3-206ENST00000431413 REP15Q6BDI9 236 aa13.08□□□□□ -0.32
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HERC3-206ENST00000431413 SLC22A24Q8N4F4 322 aa13.08□□□□□ -0.32
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HERC3-206ENST00000431413 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.08□□□□□ -0.32
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HERC3-206ENST00000431413 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.08□□□□□ -0.32
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HERC3-206ENST00000431413 SELENOVP59797 346 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 SLC36A2Q495M3 483 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 TMEM53Q6P2H8 277 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 SKA3Q8IX90 412 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 LRRC17Q8N6Y2 441 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 OR4D11Q8NGI4 311 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 HPS1Q92902 700 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-206ENST00000431413 LRRC58Q96CX6 371 aa13.07□□□□□ -0.32
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