RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 MALT1Q9UDY8 824 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 BAG5Q9UL15 447 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 CADP27708 2225 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANK2Q01484 3957 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDLIM1O00151 329 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR2T1O43869 369 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIPRLO75663 272 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LYZL6O75951 148 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 VAMP5O95183 116 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 BGLAPP02818 100 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAP2AP10114 183 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 BMP4P12644 408 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV1-2P23083 117 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSPA13P48723 471 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SELENOWP63302 87 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 VLDLRP98155 873 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LPCAT4Q643R3 524 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC22A25Q6T423 547 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSX8Q7RTT4 187 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 DTX2Q86UW9 622 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 PROX1Q92786 737 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 APH1AQ96BI3 265 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 PYURFQ96I23 114 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 RADILQ96JH8 1075 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHID1Q9BWS9 393 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNS2Q9ULS6 477 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 RASD1Q9Y272 281 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPRXA6NFQ7 191 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0R082 166 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 GNGT2O14610 69 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LMX1BO60663 402 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SERPINA1P01009 418 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 PEX2P28328 305 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRPRP30550 384 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR1E2P47887 323 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LIPNQ5VXI9 398 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 CBLL1Q75N03 491 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF525Q8N782 197 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCAIQ8N9R8 606 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LZICQ8WZA0 190 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 HTRA1Q92743 480 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPP4Q96JB8 637 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SELENONQ9NZV5 590 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 V9GYQ6 96 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 SHISA9B4DS77 424 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRN3E7EW58 273 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 MS4A18H0YCH9 400 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 H0YJX3 145 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF432O94892 652 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR5F1O95221 314 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF682O95780 498 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms