RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPRP12270 2363 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRGMA1A4Y4 181 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERVH48-1M5A8F1 160 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 VAMP5O95183 116 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF43P17038 809 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCKP27707 260 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1DQ13901 141 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRMP1Q14194 572 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 MESTQ5EB52 335 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR139Q6DWJ6 353 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 NIPAL3Q6P499 406 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCSK4Q6UW60 755 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCRLAQ7L513 359 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 FGD2Q7Z6J4 655 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYB561A3Q8NBI2 242 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTP4A1Q93096 173 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 NMNAT3Q96T66 252 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL21Q9UJP4 597 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB36O95755 333 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTHP01270 115 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SFTPCP11686 197 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACVR2AP27037 513 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACVR1BP36896 505 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC17A1Q14916 467 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 EMC4Q5J8M3 183 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDFY1Q8IWB7 410 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC37A3Q8NCC5 494 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5M9Q8NGP3 310 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF519Q8TB69 540 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 ISOC1Q96CN7 298 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 PKD1L2Q7Z442 2459 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOL3O95236 402 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNGR4O95473 234 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL10O95999 233 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRTCAP3Q53RY4 240 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARMC4Q5T2S8 1044 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR9K2Q8NGE7 335 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 FNDC9Q8TBE3 224 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZPLD1Q8TCW7 415 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASB10Q8WXI3 467 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 EMC6Q9BV81 110 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF9O43307 516 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAICSP22234 425 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 DAP3P51398 398 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 JAZF1Q86VZ6 243 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 PM20D2Q8IYS1 436 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPEPL1Q8NDH3 523 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABHD3Q8WU67 409 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITPR1Q14643 2758 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR14I1A6ND48 311 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPIPB13A6NJU9 1138 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPIPB4C9JG80 1138 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 H7C1C5 153 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 M0R3G1 203 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYTIPO60759 359 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 TDGF1P3P51864 188 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 LCN6P62502 163 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 RUNX1T1Q06455 604 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 POU4F3Q15319 338 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST3GAL2Q16842 350 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL12Q53G59 568 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNLSQ5VYX0 342 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 LEG1Q6P5S2 330 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 CREB3L2Q70SY1 520 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 YIPF3Q9GZM5 350 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASF1BQ9NVP2 202 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLEC2DQ9UHP7 191 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERGIC3Q9Y282 383 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF716A6NP11 495 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMUO75648 421 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 AQP8O94778 261 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 BIDP55957 195 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHFQ7M4L6 423 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 DDOQ99489 341 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 FUNDC2Q9BWH2 189 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRRG4Q9BZD6 226 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR51V1Q9H2C8 321 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR6C68A6NDL8 312 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 XKRYO14609 159 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-202ENST00000380221 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa24.67■■□□□ 1.54
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