RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376959.6

KCNC3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNC3, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3-201ENST00000376959 KIRREL1Q96J84 757 aa20.62■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TPPP3Q9BW30 176 aa20.62■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 MED9Q9NWA0 146 aa20.62■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ST8SIA3O43173 380 aa20.62■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 LGI1O95970 557 aa20.62■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PELI3Q8N2H9 469 aa20.62■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM235A6NFC5 223 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SEC14L6B5MCN3 397 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 IQCF3P0C7M6 154 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 RAB1AP62820 205 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 LTC4SQ16873 150 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 MISPQ8IVT2 679 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ST8SIA2Q92186 375 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 HSD17B8Q92506 261 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SCPEP1Q9HB40 452 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 K7EQM0 130 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 OR5M10Q6IEU7 315 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SPACA1Q9HBV2 294 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 APEHP13798 732 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 MEP1BQ16820 701 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 GDPD3Q7L5L3 318 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PRSS45Q7RTY3 260 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 XRCC3O43542 346 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SUMF1Q8NBK3 374 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 FGGYQ96C11 551 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CLDN17P56750 224 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 OR14A16Q8NHC5 309 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PBX4Q9BYU1 374 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 WWTR1Q9GZV5 400 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CCSO14618 274 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CD63P08962 238 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 MAOBP27338 520 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 OR6K3Q8NGY3 331 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SEH1LQ96EE3 360 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 LHX6Q9UPM6 363 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 A0A1B0GWA3 101 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ISL1P61371 349 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 REEP6Q96HR9 211 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 HSPB6O14558 160 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 BTNL8Q6UX41 500 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 C17orf107Q6ZR85 190 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CDC14CA4D256 554 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 OR8U8P0C7N1 319 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 GPX2P18283 190 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CATSPERDQ86XM0 798 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 FAM185AQ8N0U4 392 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PLPP7Q8NBV4 271 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 GLCEO94923 617 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PHLDA2Q53GA4 152 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 C12orf57Q99622 126 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 NENFQ9UMX5 172 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF587BE7ETH6 402 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 GFRA2O00451 464 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 CD80P33681 288 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SLC35A2P78381 396 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 UBQLN3Q9H347 655 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNC3-201ENST00000376959 PRAMEF4O60810 478 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms