RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ACVR1BP36896 505 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MEOX2P50222 304 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PRKAG1P54619 331 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DPTQ07507 201 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FUT5Q11128 374 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP8Q13202 625 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HSPB2Q16082 182 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00303Q3SY05 128 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SNX33Q8WV41 574 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM239Q8WW34 195 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FAM3CQ92520 227 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ARRDC3Q96B67 414 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ARL5BQ96KC2 179 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 JMJD8Q96S16 334 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 BEX1Q9HBH7 125 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NTMQ9P121 344 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FAM183AA6NL82 134 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 H7C417 338 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 BCL2L11O43521 198 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 XRCC3O43542 346 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CD8AP01732 235 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GP1BAP07359 652 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A4P12235 298 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DPP4P27487 766 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 COL8A1P27658 744 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RFC3P40938 356 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 P2RY2P41231 377 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 P2RX1P51575 399 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR12D2P58182 307 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 E2F1Q01094 437 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF85Q03923 595 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GPR68Q15743 365 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CEBPEQ15744 281 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF613Q6PF04 617 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF546Q86UE3 836 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 COMTD1Q86VU5 262 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MMP21Q8N119 569 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NUP43Q8NFH3 380 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TCEAL3Q969E4 200 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DTD2Q96FN9 168 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GUCD1Q96NT3 240 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TBX5Q99593 518 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FANCFQ9NPI8 374 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CA10Q9NS85 328 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 WDR45Q9Y484 360 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CDH23Q9H251 3354 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ANTXRLA6NF34 631 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC72A6NJI9 287 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LGALS8O00214 317 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GOSR2O14653 212 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS11DO60235 418 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CTNSO60931 367 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SPDEFO95238 335 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A10O95528 541 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 IFI6P09912 130 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GKN3PP0CG01 181 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF35P13682 527 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FOSL1P15407 271 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EDNRAP25101 427 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PAX6P26367 422 aa6.55□□□□□ -1.36
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