RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365367.1

RNU6-53P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 53, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-53P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-53P-201ENST00000365367 TNFRSF14Q92956 283 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LHX4Q969G2 390 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 APH1AQ96BI3 265 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 RAB39BQ96DA2 213 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMCO6Q96DC7 493 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 C16orf58Q96GQ5 468 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 VPS39Q96JC1 886 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FOPNLQ96NB1 174 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FRG2BQ96QU4 278 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 DDOQ99489 341 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 P2RX4Q99571 388 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 RBBP8Q99708 897 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GAL3ST1Q99999 423 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PCGF1Q9BSM1 259 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 HAUS8Q9BT25 410 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LRRC1Q9BTT6 524 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM129AQ9BZQ8 928 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRIM5Q9C035 493 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PCBD2Q9H0N5 130 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 HIPK2Q9H2X6 1198 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LRRC40Q9H9A6 602 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FKRPQ9H9S5 495 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM165Q9HC07 324 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 NOX4Q9NPH5 578 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SCRT2Q9NQ03 307 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM114A2Q9NRY5 505 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ACOXLQ9NUZ1 547 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TAAR3PQ9P1P4 343 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 B3GAT1Q9P2W7 334 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LCMT1Q9UIC8 334 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PHF11Q9UIL8 331 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF225Q9UK10 706 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 VPREB3Q9UKI3 123 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CARD8Q9Y2G2 431 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 AMDHD2Q9Y303 409 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SNX8Q9Y5X2 465 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PSAT1Q9Y617 370 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 NPTNQ9Y639 398 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 POMT1Q9Y6A1 747 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 USH1CQ9Y6N9 552 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 DSPPQ9NZW4 1301 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM72A0PK05 275 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ISPDA4D126 451 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 URADA6NGE7 173 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ANKDD1BA6NHY2 528 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CLDN24A6NM45 220 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CLDN25C9JDP6 229 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 E5RI56 91 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 E9PQ18 207 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 H3BUX3 64 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MLNRO43193 412 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 AKAP10O43572 662 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SPRY3O43610 288 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SYNGR1O43759 233 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LIASO43766 372 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FOXH1O75593 365 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 KCNK2O95069 426 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 AKR7A3O95154 331 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 HPRP00739 348 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 IGF2P01344 180 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CRYAAP02489 173 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GYPCP04921 128 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 KLK1P06870 262 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 NGFRP08138 427 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 INHBAP08476 426 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 RBMY1CP0DJD4 496 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PCNAP12004 261 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SELLP14151 372 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF250P15622 560 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CBR1P16152 277 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PORP16435 677 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CCND1P24385 295 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CNTFRP26992 372 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PIK3R1P27986 724 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GABRA5P31644 462 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GLRXP35754 106 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GP5P40197 560 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 RAD52P43351 418 aa0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms