RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NAAAQ02083 359 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SREBF2Q12772 1141 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ALG10BQ5I7T1 473 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 TMEM88Q6PEY1 159 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ULK3Q6PHR2 472 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FAM122BQ7Z309 247 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FGF13Q92913 245 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 COL26A1Q96A83 441 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SMIM10Q96HG1 83 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 SEC11CQ9BY50 192 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 COL4A2P08572 1712 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TMEM212A6NML5 194 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LINC01387J3KSC0 135 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SULT2B1O00204 365 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 CD37P11049 281 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MPZP25189 248 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 DHRS2Q13268 280 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 TEAD2Q15562 447 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 AVPI1Q5T686 147 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LHX8Q68G74 356 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.25□□□□□ -0.77
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GINS3-202ENST00000328514 TIMM29Q9BSF4 260 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ALG12Q9BV10 488 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 HDAC8Q9BY41 377 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RNF122Q9H9V4 155 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 COMMD9Q9P000 198 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NUP210LQ5VU65 1888 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 A0A087WV48 116 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NPIPA7E9PJI5 369 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 P2RX6O15547 441 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZNF735P0CB33 412 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NPIPA8P0DM63 369 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ITGB8P26012 769 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 DLSTP36957 453 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 EFNB2P52799 333 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 GUCA2AQ02747 115 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CBLN2Q8IUK8 224 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR6K6Q8NGW6 343 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 THAP6Q8TBB0 222 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ARL11Q969Q4 196 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SEH1LQ96EE3 360 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PDCD10Q9BUL8 212 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC2A8Q9NY64 477 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 DAPP1Q9UN19 280 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC22A7Q9Y694 548 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 WNT6Q9Y6F9 365 aa10.24□□□□□ -0.77
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