RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ALDH3B1P43353 468 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 CDH15P55291 814 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RBBP4Q09028 425 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 CCNIQ14094 377 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RAB39AQ14964 217 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 NPTX1Q15818 432 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 CYP51A1Q16850 503 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 LIPNQ5VXI9 398 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 LRP11Q86VZ4 500 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SKA3Q8IX90 412 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 GPR32P1Q8NGA4 272 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM54Q969K7 222 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RABEP2Q9H5N1 569 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.87■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 CH25HO95992 272 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 PATE4P0C8F1 98 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SEC24CP53992 1094 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SELPLGQ14242 412 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF74Q16587 644 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 FXNQ16595 210 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ELFN2Q5R3F8 820 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 OR6X1Q8NH79 312 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 FGFBP3Q8TAT2 258 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf159Q96HA4 380 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 GLTPQ9NZD2 209 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 FZR1Q9UM11 496 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.86■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 LYPD3O95274 346 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 HPXP02790 462 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 THY1P04216 161 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SERPINA5P05154 406 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 LSP1P33241 339 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SRP14P37108 136 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 MTPNP58546 118 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ZP4Q12836 540 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SLC22A24Q8N4F4 322 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 DPP10Q8N608 796 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 CGREF1Q99674 301 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 NANSQ9NR45 359 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 DUSP13Q9UII6 198 aa16.85■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ANGPT2O15123 496 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RNF13O43567 381 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 COL8A2P25067 703 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 MELKQ14680 651 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RETREG3Q86VR2 466 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 CARM1Q86X55 608 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RFLNBQ8N5W9 214 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 RDH5Q92781 318 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF566Q969W8 418 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM38BQ9NVV0 291 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.84■□□□□ 0.29
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PPW3 197 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 TCF21O43680 179 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 ACHEP22303 614 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 REP15Q6BDI9 236 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 RINLQ6ZS11 566 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 SH3GL3Q99963 347 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 NARFLQ9H6Q4 476 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.83■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 B4DSR2 109 aa16.82■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 HAX1O00165 279 aa16.82■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 DHHO43323 396 aa16.82■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 ENTPD5O75356 428 aa16.82■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 FARS2O95363 451 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 HIST1H2ABP04908 130 aa16.82■□□□□ 0.28
CXCL3-201ENST00000296026 PGA4P0DJD7 388 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms