RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288840.9

SMAD6-201, Transcript of SMAD family member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD6, Length 3,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6-201ENST00000288840 ARHGDIBP52566 201 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 GAS1P54826 345 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 CHAF1BQ13112 559 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 S100A13Q99584 98 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 CD38P28907 300 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ARFRP1Q13795 201 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ETFDHQ16134 617 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 MED11Q9P086 117 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 EFCAB7A8K855 629 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 DCTN6O00399 190 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 AKR1C4P17516 323 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 LINC00303Q3SY05 128 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ELP2Q6IA86 826 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 MDGA2Q7Z553 956 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 A0A087WUJ7 227 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 GPRIN2O60269 458 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF28P17035 718 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 CBFBQ13951 182 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SERTAD2Q14140 314 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 RNLSQ5VYX0 342 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 RAB3DO95716 219 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SLC2A5P22732 501 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 HSD11B1P28845 292 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 BCL2A1Q16548 175 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 TMEM225Q6GV28 225 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 LRRC61Q9BV99 259 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 WBP1LQ9NX94 342 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 APOC3P02656 99 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF35P13682 527 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SORDQ00796 357 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 TCTN2Q96GX1 697 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SUSD5O60279 629 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 B3GALNT1O75752 331 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 TAS2R20P59543 309 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 BTG1P62324 171 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 BDH1Q02338 343 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 FZD2Q14332 565 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 Q6ZTK2 550 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 AKR7A3O95154 331 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SELENOPP49908 381 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 TLE3Q04726 772 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 OPCMLQ14982 345 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ACKR1Q16570 336 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 PHF19Q5T6S3 580 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD6-201ENST00000288840 CCSO14618 274 aa14.46□□□□□ -0.1
SMAD6-201ENST00000288840 MPZL1O95297 269 aa14.46□□□□□ -0.1
SMAD6-201ENST00000288840 HCKP08631 526 aa14.46□□□□□ -0.1
SMAD6-201ENST00000288840 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF440Q8IYI8 595 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms