RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ASAH1Q13510 395 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO8Q9NRD0 319 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TM7SF3Q9NS93 570 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LHX6Q9UPM6 363 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 H3BNC9 293 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GP2P55259 537 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HBG1P69891 147 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HBG2P69892 147 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OXA1LQ15070 435 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LPAL2Q16609 132 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 NKAIN4Q8IVV8 208 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZFPM2Q8WW38 1151 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01599Q8WXQ3 324 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 Q96M85 177 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WUU8 490 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TLE4Q04727 773 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP5Q16690 384 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SFRP5Q5T4F7 317 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RASD2Q96D21 266 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LRFN5Q96NI6 719 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RAB19A4D1S5 217 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TARM1B6A8C7 271 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LALBAP00709 142 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF20Q5VT98 475 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00346Q8IVM7 164 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PLPP5Q8NEB5 264 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ULBP3Q9BZM4 244 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 WASH6PQ9NQA3 447 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DAPP1Q9UN19 280 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM202A6NGA9 273 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM200CA6NKL6 621 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 HMGN4O00479 90 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CNR1P21554 472 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 DPTQ07507 201 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf140Q5VVS0 124 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OLIG3Q7RTU3 272 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 FGGYQ96C11 551 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 CALCBP10092 127 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PXT1Q8NFP0 134 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO4A1Q96BD0 722 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 SGPP1Q9BX95 441 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OR14J1Q9UGF5 321 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C65A6NJZ3 312 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 TSTD3H0UI37 97 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GABARAPH6UMI1 98 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 GRINAQ7Z429 371 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 S100A7AQ86SG5 101 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 OR5D18Q8NGL1 313 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZAR1LA6NP61 321 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SYT9Q86SS6 491 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PISDQ9UG56 409 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOFO60613 162 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF74Q16587 644 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CADM3Q8N126 398 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TERB2Q8NHR7 220 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PIGQQ9BRB3 760 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB11Q9NX14 153 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MED16Q9Y2X0 877 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5BO43169 146 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 RAF1P04049 648 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 EBPQ15125 230 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SPPL3Q8TCT6 385 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SECTM1Q8WVN6 248 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ISYNA1Q9NPH2 558 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GPR171O14626 319 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PDGFAP04085 211 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ETV1P50549 477 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 FCRL6Q6DN72 434 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR1J2Q8NGS2 313 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SDF2Q99470 211 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PKMYT1Q99640 499 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf72A6NCS6 295 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf112F2Z3M2 114 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-27P01718 113 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA5P54756 1037 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GRB2P62993 217 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf135Q5VTT2 229 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D5Q6ZV89 423 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CAMKMTQ7Z624 323 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 M0QYG6 137 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CPEP16870 476 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CD53P19397 219 aa19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms