RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 HAAOP46952 286 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 EPHA4P54764 986 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 S100A12P80511 92 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF85Q03923 595 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 IKZF1Q13422 519 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DPPA4Q7L190 304 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM239Q8WW34 195 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FGF11Q92914 225 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PELI1Q96FA3 418 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LMF1Q96S06 567 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MS4A8Q9BY19 250 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MED31Q9Y3C7 131 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM218A2RU14 115 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 M0QYG6 137 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF254O75437 659 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AMY2AP04746 511 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SRFP11831 508 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CPN1P15169 458 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 BCKDHBP21953 392 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MST1P26927 711 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PTGFRP43088 359 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PPT1P50897 306 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FZD5Q13467 585 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PON3Q15166 354 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FAM122BQ7Z309 247 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CDS1Q92903 461 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SHDQ96IW2 340 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LYSMD1Q96S90 227 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PIGMQ9H3S5 423 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MIOXQ9UGB7 285 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR5H14A6NHG9 310 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZGLP1P0C6A0 271 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 C5AR1P21730 350 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 GALP22466 123 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AGTR1P30556 359 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RFC3P40938 356 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PRLHRP49683 370 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PRKXP51817 358 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ADPRHP54922 357 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CDK5R1Q15078 307 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PEA15Q15121 130 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DECR1Q16698 335 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 STOML3Q8TAV4 291 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR2A4O95047 310 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CD3DP04234 171 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MGMTP16455 207 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DRD3P35462 400 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FUT5Q11128 374 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 GAS6Q14393 721 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR2A7Q96R45 310 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 COA4Q9NYJ1 87 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TECTAO75443 2155 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CACNA1AO00555 2505 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AQP8O94778 261 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SNAPINO95295 136 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FOSL1P15407 271 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NPBWR1P48145 328 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ACTC1P68032 377 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ACTA1P68133 377 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LTBQ06643 244 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NAA40Q86UY6 237 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.9□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms