RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.87□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 FGF21Q9NSA1 209 aa14.87□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SEC16AO15027 2179 aa14.87□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SCN2AQ99250 2005 aa14.87□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ZNF98A6NK75 572 aa14.87□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PHYHO14832 338 aa14.87□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 IL33O95760 270 aa14.87□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SPI1P17947 270 aa14.87□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 IER2Q9BTL4 223 aa14.87□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.87□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.86□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PHYHIPQ92561 330 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 LRRC46Q96FV0 321 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PTP4A3O75365 173 aa14.86□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 LY86O95711 162 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ODF4Q2M2E3 257 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 C5orf51A6NDU8 294 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PLPP2O43688 288 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 IGKV1D-16P01601 117 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SYPP08247 313 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 UCHL1P09936 223 aa14.86□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 AANATQ16613 207 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ZNF511Q8NB15 262 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.86□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SPEGQ15772 3267 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 IGLV3-19P01714 112 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SPARCP09486 303 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 MAP3K8P41279 467 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 HACD4Q5VWC8 232 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 INTS14Q96SY0 518 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 LAT2Q9GZY6 243 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 A0A1B0GX78 115 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TMEM72A0PK05 275 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 FRG2CA6NGY1 282 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ARPC3O15145 178 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PRH1P02810 166 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CTSBP07858 339 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CT45A8P0DMV1 189 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CT45A9P0DMV2 189 aa14.85□□□□□ -0.03
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CTCF-201ENST00000264010 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 RARRES3Q9UL19 164 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 HRO43593 1189 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CDK5R1Q15078 307 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ZNF79Q15937 498 aa14.85□□□□□ -0.03
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