RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 UBQLN2Q9UHD9 624 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR171O14626 319 aa23.86■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 NTN1O95631 604 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 GIFP27352 417 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL11P51671 97 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMK2DQ13557 499 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD37Q7Z713 158 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4N5Q8IXE1 308 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 TIGD4Q8IY51 512 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 EXD3Q8N9H8 876 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPP5Q8NEB5 264 aa23.86■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.86■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 MAT2BQ9NZL9 334 aa23.86■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 NAP1L6A6NFF2 107 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EM74 188 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX12O00623 359 aa23.85■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 PTGER1P34995 402 aa23.85■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 PCOLCEQ15113 449 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2L13Q8N349 312 aa23.85■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PS29 197 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 FXYD6P3P58550 94 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A11Q8NCK7 471 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 CDS1Q92903 461 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf36Q96KX1 117 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRL4Q9HBW9 690 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR11H4Q8NGC9 324 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM4Q8WVI0 70 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX5Q99593 518 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT27Q9BW83 186 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA4CQ9C0C4 833 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 DLL4Q9NR61 685 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 J3QLW9 94 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHEP01854 428 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 EPXP11678 715 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF19P17023 458 aa23.83■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 SDF2Q99470 211 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF350Q9GZX5 532 aa23.83■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 MED20Q9H944 212 aa23.83■■□□□ 1.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 E9PI62 339 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNGP01579 166 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PRG2P13727 222 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MAKP20794 623 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 AP3S2P59780 193 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1Q1Q15612 314 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7G2Q8NG99 324 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GIMAP1Q8WWP7 306 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GHSRQ92847 366 aa23.82■■□□□ 1.4
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