RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF546Q86UE3 836 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC35G3Q8N808 338 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TIMD4Q96H15 378 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KIRREL1Q96J84 757 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RAF1P04049 648 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CD14P08571 375 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SBK2P0C263 348 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PVRP15151 417 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TBPP20226 339 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RAB6AP20340 208 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MAOBP27338 520 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HLA-DMAP28067 261 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GDNFP39905 211 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 IHHQ14623 411 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LSMEM2Q8N112 164 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RNF141Q8WVD5 230 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BTAF1O14981 1849 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GWA3 101 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TAPBPO15533 448 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PIP5K1CO60331 668 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FBXO45P0C2W1 286 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PFN3P60673 137 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 AKR1C1Q04828 323 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR2A14Q96R47 310 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.66□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMEM129A0AVI4 362 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HLA-HP01893 362 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 APOA2P02652 100 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ADH4P08319 380 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 EVI2BP34910 448 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CYB561P49447 251 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ACSM1Q08AH1 577 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SEMA3BQ13214 749 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC10A1Q14973 349 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 XKR7Q5GH72 579 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LGI3Q8N145 548 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MITD1Q8WV92 249 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 APH1AQ96BI3 265 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SDSLQ96GA7 329 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CHST11Q9NPF2 352 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 USP22Q9UPT9 525 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MYH4Q9Y623 1939 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RAD1O60671 282 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TUSC2O75896 110 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CNR1P21554 472 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CASP3P42574 277 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SORDQ00796 357 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 EGR3Q06889 387 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ARL16Q0P5N6 197 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HNF4GQ14541 408 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TATDN3Q17R31 274 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF425Q6IV72 752 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CD163Q86VB7 1156 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RETREG3Q86VR2 466 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FBXO27Q8NI29 283 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CSF3RQ99062 836 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GM2AP17900 193 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MAP2K6P52564 334 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms