RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd14P10810 366 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstm5P48774 224 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yes1Q04736 541 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Agbl4Q09LZ8 540 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd55Q61475 390 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptp4a1Q63739 173 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9758Q80ZT2 255 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Noxa1Q8CJ00 444 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 V1ra11Q8R2E6 318 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r45Q8VIC7 318 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sfxn2Q925N2 322 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdm5Q9CXE0 599 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35a4Q9D321 324 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alg5Q9DB25 324 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P2ry14Q9ESG6 338 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Raet1dQ9JI58 249 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sorcs1Q9JLC4 1167 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh20Q9Z0M3 801 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfhx3Q61329 3726 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm884A2A9H6 3643 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11634A0A1B0GSX1 172 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r108E9PYS0 855 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arg2O08691 354 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epha8O09127 1004 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-ObO35424 271 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdh12O55134 1180 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sod1P08228 154 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rplp0P14869 317 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd3b3P26150 373 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FshrP35378 692 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nat2P50295 290 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aqp8P56404 261 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S100a13P97352 98 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmklr1P97468 371 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pak6Q3ULB5 682 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DraxinQ6PAL1 343 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrit2Q6PFC5 549 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo5Q7TSG3 421 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A730049H05RikQ8C940 139 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw17Q8CFE8 466 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a42Q8R0Y8 318 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med9Q8VCS6 142 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr164Q8VF87 315 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PnpoQ91XF0 261 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SelenosQ9BCZ4 190 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tprg1lQ9DBS2 266 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtgesQ9JM51 153 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc7a5Q9Z127 512 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11214V9GX06 183 aa11.58□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1338A2ACY7 313 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp989H3BLB0 661 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plscr5J3QM92 274 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r175K7N6T9 304 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20878L7N244 103 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcsk4P29121 655 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Egfbp2P36368 261 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CpoxP36552 443 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MakQ04859 622 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3KQP7 184 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10750Q3V0I0 133 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xkr7Q5GH64 580 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttf1Q62187 859 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr645Q7TRQ1 315 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr68Q8BFQ3 365 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a32Q8BMG8 316 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Flywch1Q8CI03 673 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsen15Q8R3W5 168 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LgalslQ8VED9 172 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr98Q8VFD9 309 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc7a13Q91WN3 478 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsa2Q9CR47 260 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NaxdQ9CZ42 343 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stra6lQ9DBN1 621 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arfgap1Q9EPJ9 414 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf8Q9EQH4 308 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xpr1Q9Z0U0 695 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glb1l3A2RSQ1 649 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1221L7MU53 311 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep76Q0VEJ0 659 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3TTL0 348 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm136Q3V037 328 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb46Q4QY34 57 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HpQ61646 347 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grm7Q68ED2 915 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr119Q7TQP3 335 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr657Q7TRP7 319 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pou6f2Q8BJI4 691 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmp28Q8CGV8 520 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serinc2Q8K0E7 450 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crb3Q8QZT4 113 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr165Q8VFA2 313 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1426Q8VG74 311 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfand2bQ91X58 257 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufa5Q9CPP6 116 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msantd3Q9CR78 275 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdpd1Q9CRY7 314 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif3kQ9DBZ5 218 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Popdc3Q9ES81 291 aa11.57□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sp6Q9ESX2 376 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms