RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637397.1

CLN5-218, Transcript of CLN5, intracellular trafficking protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CLN5, Length 5,060 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5-218ENST00000637397 TAS2R20P59543 309 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 ZP2Q05996 745 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 DUSP8Q13202 625 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 ST8SIA4Q92187 359 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SMIM19Q96E16 107 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 EHFQ9NZC4 300 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 ABI3Q9P2A4 366 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 EFCAB7A8K855 629 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 CCSO14618 274 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SEC14L5O43304 696 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 INHBBP09529 407 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SDHBP21912 280 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 IFNGR1P15260 489 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 CDK5R1Q15078 307 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 TEX261Q6UWH6 196 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SULF2Q8IWU5 870 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 MR1Q95460 341 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 U3KQ87 197 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 IFITM5A6NNB3 132 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 FGF17O60258 216 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 PMS2P2O95744 297 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 GPR157Q5UAW9 335 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 TSSK2Q96PF2 358 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 KLK11Q9UBX7 282 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 PER3P56645 1201 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 STACQ99469 402 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SULT1C2O00338 296 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SPI1P17947 270 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 CD53P19397 219 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 AKR1C2P52895 323 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 AKR1C1Q04828 323 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 MELKQ14680 651 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 ALG14Q96F25 216 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 LCATP04180 440 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SERPINA2P20848 420 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 PPT1P50897 306 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 AIPO00170 330 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 TXNL1O43396 289 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 EPXP11678 715 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 METAP1P53582 386 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 CDK5Q00535 292 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 RTL10Q7L3V2 364 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 FBXL6Q8N531 539 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.58□□□□□ -0.07
CLN5-218ENST00000637397 GMDSO60547 372 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 DCTDP32321 178 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 ZG16BQ96DA0 208 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 LRRC46Q96FV0 321 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 POFUT1Q9H488 388 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 IL20Q9NYY1 176 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 SUSD5O60279 629 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 IL33O95760 270 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 CCR2P41597 374 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 DIO1P49895 249 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 ZFP57Q9NU63 452 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN5-218ENST00000637397 P2RY10O00398 339 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms