RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC43A2Q8N370 569 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5W2Q8NH69 310 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM19Q9H013 955 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 DSN1Q9H410 356 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 IL20Q9NYY1 176 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CARD8Q9Y2G2 431 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC1A3P43003 542 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 GIPRP48546 466 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RX1P51575 399 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 IL5RAQ01344 420 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 APOFQ13790 326 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR88Q6ZMY6 472 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCH3Q86UD3 253 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5M1Q8NGP8 315 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A19Q9HC21 320 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SDHAF3Q9NRP4 125 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF175Q9Y473 711 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WXM4 84 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CRLF1O75462 422 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 AQP8O94778 261 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PLAUP00749 431 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PGCP20142 388 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CRHBPP24387 322 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 GABARAPL2P60520 117 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK5Q00535 292 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf73Q69YU5 71 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 LAIR2Q6ISS4 152 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CBLN3Q6UW01 205 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4K17Q8NGC6 315 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 OSTF1Q92882 214 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf49Q96BT1 292 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM43Q9BTV4 400 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MED11Q9P086 117 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2M5A3KFT3 312 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM18P0DKX4 95 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRB1P18505 474 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF117Q03924 483 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PON3Q15166 354 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A30Q5SVS4 291 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ENTHD1Q8IYW4 607 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 MEIOBQ8N635 442 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM204Q9BSN7 226 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-216ENST00000628306 A6NHS1 94 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 OIP5O43482 229 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 SCO2O43819 266 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CLPTM1O96005 669 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 HK1P19367 917 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 IDH2P48735 452 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CBFBQ13951 182 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM44Q2T9K0 475 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFAF6Q330K2 333 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 RAET1LQ5VY80 246 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMP1BQ7LBR1 199 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CADM2Q8N3J6 435 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIFA2Q96DR5 249 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TPRKBQ9Y3C4 175 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BN98 237 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC14L5O43304 696 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ELK4P28324 431 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL5P46777 297 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 EFNB1P98172 346 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 STAC2Q6ZMT1 411 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM214BQ7L5A3 538 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 GGNQ86UU5 652 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 GATSQ8NAP1 163 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 LIPHQ8WWY8 451 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 DTNBP1Q96EV8 351 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 IMPAD1Q9NX62 359 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 PROCRQ9UNN8 238 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH10Q9Y6N8 788 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC119BA6NIH7 251 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 IFI30P13284 250 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR3AP46098 478 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 NR1H2P55055 460 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TNK1Q13470 666 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 BEX5Q5H9J7 111 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8J1Q8NGP2 316 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR119Q8TDV5 335 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP19Q8WTR2 217 aa21.36■■□□□ 1.01
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