RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	CLCN7	P51798	805 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CDH13	P55290	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1B0GVL5	298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC43A1	O75387	559 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP1B1	P05026	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	NCK1	P16333	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMB10	P40306	273 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	RAP1GDS1	P52306	607 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGF	Q07326	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R082	166 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CCRL2	O00421	344 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OVOL1	O14753	267 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PFDN6	O15212	129 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	DNPH1	O43598	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TFPI	P10646	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ETS1	P14921	441 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKCA	P17252	672 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	GNAZ	P19086	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	KDELR1	P24390	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SYK	P43405	635 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CRADD	P78560	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ICAM4	Q14773	271 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF130	Q86XS8	419 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	EBPL	Q9BY08	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NLC8	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SURF4	O15260	269 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FSTL3	O95633	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PMS2P2	O95744	297 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	G6PD	P11413	515 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R2	P41236	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	NR2C2	P49116	596 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	AP1S2	P56377	157 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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