RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ID3	Q02535	119 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MGAT2	Q10469	447 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	RABEP1	Q15276	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061		Q6ZRM9	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TAPBP	O15533	448 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB36	O95755	333 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PDYN	P01213	254 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	C8G	P07360	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061		P0DMU3	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OR3A4P	P47883	348 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC9A3	P48764	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CLCN7	P51798	805 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CDH13	P55290	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1B0GVL5	298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC43A1	O75387	559 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP1B1	P05026	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	NCK1	P16333	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GSTT1	P30711	240 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMB10	P40306	273 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	RAP1GDS1	P52306	607 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PIGF	Q07326	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CCRL2	O00421	344 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	OVOL1	O14753	267 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	PFDN6	O15212	129 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	DNPH1	O43598	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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