RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa25.23■■□□□ 1.63
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SEMA3B-215ENST00000621029 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF229Q9UJW7 825 aa25.23■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CD79AP11912 226 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 KDELR2P33947 212 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 ARR3P36575 388 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP2R2BQ00005 443 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 C3orf36Q3SXR2 165 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CLEC2AQ6UVW9 174 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 MICU2Q8IYU8 434 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM169BQ8N8A8 192 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 SEC61A2Q9H9S3 476 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CA10Q9NS85 328 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R5Q9NYW4 299 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 ELOVL7A1L3X0 281 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 H7C417 338 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 IGLV1-44P01699 117 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 CELA3BP08861 270 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 COX4I1P13073 169 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 NHLRC1Q6VVB1 395 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 MDP1Q86V88 176 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 WDFY1Q8IWB7 410 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PRSS27Q9BQR3 290 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 RIMS3Q9UJD0 308 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA3B-215ENST00000621029 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5F1O95221 314 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 IGKV3-15P01624 115 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 HLA-HP01893 362 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 B4GALT1P15291 398 aa25.2■■□□□ 1.62
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SEMA3B-215ENST00000621029 ZP4Q12836 540 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ARPINQ7Z6K5 226 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NKAIN4Q8IVV8 208 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4F15Q8NGB8 312 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF426Q9BUY5 554 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 AP3M1Q9Y2T2 418 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 CSPG4Q6UVK1 2322 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 TLN2Q9Y4G6 2542 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 TP53P04637 393 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 CALCRP30988 508 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 PIGFQ07326 219 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 MELKQ14680 651 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 OR6X1Q8NH79 312 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 PFN4Q8NHR9 129 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM255BQ8WV15 326 aa25.19■■□□□ 1.62
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SEMA3B-215ENST00000621029 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 CMTM6Q9NX76 183 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 VSTM5A8MXK1 200 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 GSTA4O15217 222 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 MT-ND1P03886 318 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4A8P0C604 315 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 IFNA8P32881 189 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 RBM34P42696 430 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 DSCR9P59020 149 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 GSG1Q2KHT4 349 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 DNM1P46Q6ZS02 220 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM239Q8WW34 195 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF566Q969W8 418 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SGTBQ96EQ0 304 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 FOXB1Q99853 325 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 GLTPQ9NZD2 209 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NAV3Q8IVL0 2385 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ZANQ9Y493 2812 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 INAFM1C9JVW0 142 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 BCL10O95999 233 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ASAH2BP0C7U1 165 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 FUT1P19526 365 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 EFNA4P52798 201 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 UGT2B15P54855 530 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 LIPEQ05469 1076 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 MST1LQ2TV78 715 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF525Q8N782 197 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 EFCAB1Q9HAE3 211 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 HIVEP2P31629 2446 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 MCIDASD6RGH6 385 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 OR7A10O76100 309 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SELENOWP63302 87 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SWI5Q1ZZU3 235 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SPATA21Q7Z572 469 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC15A3Q8IY34 581 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 IL17RDQ8NFM7 739 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM54Q969K7 222 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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