RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CDC20Q12834 499 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PKMYT1Q99640 499 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LDB2O43679 373 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MPIG6BO95866 241 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 IL5P05113 134 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RABIFP47224 123 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MTNR1BP49286 362 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OPN5Q6U736 354 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2L13Q8N349 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PRR18Q8N4B5 295 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS8O00214 317 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PEX10O60683 326 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ASAH1Q13510 395 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LAX1Q8IWV1 398 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 COMMD1Q8N668 190 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LMO3Q8TAP4 145 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C14orf79Q96F83 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 POFUT1Q9H488 388 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CNIH4Q9P003 139 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM72A0PK05 275 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CCR7P32248 378 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC14A1Q13336 389 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CEBPEQ15744 281 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PDZD3Q86UT5 571 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 VCX2Q9H322 139 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NIT2Q9NQR4 276 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS4P56470 323 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf58Q96LI9 332 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NTMT1Q9BV86 223 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TPPP3Q9BW30 176 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LCATP04180 440 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TIMP2P16035 220 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ID2Q02363 134 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CARFQ8N187 725 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FRMD1Q8N878 549 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FABP7O15540 132 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DDAH2O95865 285 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 M6PRP20645 277 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OPRD1P41143 372 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 METTL9Q9H1A3 318 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 Q9Y3F1 56 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HIDE1A8MVS5 230 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TUSC2O75896 110 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HMGCLP35914 325 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NAGSQ8N159 534 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RNF175Q8N4F7 328 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SNED1Q8TER0 1413 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HTR4Q13639 388 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM239Q8WW34 195 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SMOQ99835 787 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GNB4Q9HAV0 340 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RCE1Q9Y256 329 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DBX1A6NMT0 343 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 K7ERU9 68 aa6.49□□□□□ -1.37
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