RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NCAN	O14594	1321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		A0A1B0GV72	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DFFA	O00273	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	LAD1	O00515	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PRRG2	O14669	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR7A10	O76100	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GUSB	P08236	651 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF35	P13682	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SPINK2	P20155	84 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MPI	P34949	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	LEP	P41159	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FAM3A	P98173	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FZD5	Q13467	585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ASAH1	Q13510	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RAB31	Q13636	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ATF6B	Q99941	703 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ARL5A	Q9Y689	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NUP160	Q12769	1436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		A0A0A6YYD5	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		A0A1W2PR80	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms