RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ORC6Q9Y5N6 252 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A20A6NK97 555 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GJE1A6NN92 205 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 E9PQ18 207 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 DCTN6O00399 190 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T1O43869 369 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 C1QL1O75973 258 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TOXO94900 526 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RCBTB2O95199 551 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 APOL3O95236 402 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CD14P08571 375 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN19P0C672 248 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CPN1P15169 458 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC6A6P31641 620 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PYCR1P32322 319 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GGT2P36268 569 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ACVR1BP36896 505 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPGP40121 348 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GIPRP48546 466 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SELENOPP49908 381 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RAC3P60763 192 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 H3F3AP84243 136 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK5Q00535 292 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IL5RAQ01344 420 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGFQ07326 219 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PUDPQ08623 228 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CD47Q08722 323 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CRMP1Q14194 572 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF11Q15544 211 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ETFDHQ16134 617 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 INAQ16352 499 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ACKR1Q16570 336 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf73Q69YU5 71 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NIPAL3Q6P499 406 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SHFQ7M4L6 423 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM122BQ7Z309 247 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 DOLPP1Q86YN1 238 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 UEVLDQ8IX04 471 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PARP8Q8N3A8 854 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MARVELD2Q8N4S9 558 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00471Q8N535 108 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT14Q8NB59 555 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NAXEQ8NCW5 288 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6S1Q8NH40 331 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 APH1BQ8WW43 257 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 LIPHQ8WWY8 451 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB10Q8WXI3 467 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NSMAFQ92636 917 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TFAP2CQ92754 450 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NMNAT3Q96T66 252 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PITX2Q99697 317 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 AMBNQ9NP70 447 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IL20Q9NYY1 176 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 UBAP1Q9NZ09 502 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS50Q9UI38 385 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OSGIN2Q9Y236 505 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNA1GO43497 2377 aa5.35□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.34□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.34□□□□□ -1.55
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