RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0B4J2E0	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1B0GX12	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PPC4	97 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRP	O00591	440 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BHLHE40	O14503	412 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PHYH	O14832	338 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF13	O43567	381 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ORC5	O43913	435 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FGF17	O60258	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNK2	O95069	426 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DHFR	P00374	187 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SBK2	P0C263	348 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRG2	P13727	222 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HPGD	P15428	266 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRG2	P18507	467 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CD27	P26842	260 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RORA	P35398	523 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GRK6	P43250	576 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PPIC	P45877	212 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR4	P46093	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HTR3A	P46098	478 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAG2	P55895	527 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BTG1	P62324	171 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB1A	P62820	205 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FABP5	Q01469	135 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FUT7	Q11130	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LTB4R	Q15722	352 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPB2	Q16082	182 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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