RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 INIPQ9NRY2 104 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 LAMP3Q9UQV4 416 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SHISA9B4DS77 424 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 J3KTA2 159 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 PIP5K1CO60331 668 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FAM107AO95990 144 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 IGHG1P01857 330 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 HSD17B1P14061 328 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 CLRN1P58418 232 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SPOCK1Q08629 439 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 MELKQ14680 651 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 KRT72Q14CN4 511 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 AGAP6Q5VW22 663 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ZNF730Q6ZMV8 503 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 DEFB107AQ8IZN7 70 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FBXL14Q8N1E6 418 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ZNF566Q969W8 418 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 CDRT15Q96T59 188 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 GSX2Q9BZM3 304 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 C20orf141Q9NUB4 165 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TAS2R5Q9NYW4 299 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 RHCGQ9UBD6 479 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 AKAP6Q13023 2319 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SEC14L2O76054 403 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 CRYAAP02489 173 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 NR2C1P13056 603 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ITGA2P17301 1181 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 AQP2P41181 271 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 PTH2RP49190 550 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FABP6P51161 128 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ATP5J2P56134 94 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TUBA1BP68363 451 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TUBA4AP68366 448 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ADAM8P78325 824 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TAF11Q15544 211 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SPATS1Q496A3 300 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FGD3Q5JSP0 725 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TUBA1AQ71U36 451 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 NRMQ8IXM6 262 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 LIPHQ8WWY8 451 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TMEM54Q969K7 222 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 NSL1Q96IY1 281 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FOXB1Q99853 325 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 DHRS9Q9BPW9 319 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 KATNB1Q9BVA0 655 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD19PQ9H560 264 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 GLTPQ9NZD2 209 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 EFCAB9A8MZ26 197 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 CENPBD1B2RD01 187 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 FARS2O95363 451 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 F13BP05160 661 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 SOD3P08294 240 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 DANCRP0C864 163 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 CD79AP11912 226 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 RHCEP18577 417 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 CALB2P22676 271 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 ARR3P36575 388 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 SLC9A3P48764 834 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 ZNF84P51523 738 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 PRKCDQ05655 676 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 NPRL3Q12980 569 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 ALG10Q5BKT4 473 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 ZNF544Q6NX49 715 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 PRSS57Q6UWY2 283 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 FITM2Q8N6M3 262 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-204ENST00000578208 NOXO1Q8NFA2 376 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms