RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568626.1

FANCA-231, Transcript of FA complementation group A, human

TSL 3

Gene FANCA, Length 727 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FANCA-231	ENST00000568626	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	ADCK1	Q86TW2	530 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	FNDC8	Q8TC99	324 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	ASB10	Q8WXI3	467 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	ZNF570	Q96NI8	536 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	IFT27	Q9BW83	186 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FANCA-231	ENST00000568626	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		10.65	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	COL12A1	Q99715	3063 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	SOCS2	O14508	198 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	XKRY	O14609	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	MSTN	O14793	375 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	AHCYL1	O43865	530 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	IGHG1	P01857	330 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	BMP5	P22003	454 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	NOS3	P29474	1203 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	CRISP1	P54107	249 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	BID	P55957	195 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	VWA1	Q6PCB0	445 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	FAM122B	Q7Z309	247 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	TMEM123	Q8N131	208 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	LNX2	Q8N448	690 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ZNF519	Q8TB69	540 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ZNF566	Q969W8	418 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	STARD4	Q96DR4	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	LRR1	Q96L50	414 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	OR2M2	Q96R28	347 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	SNX18	Q96RF0	628 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ALG12	Q9BV10	488 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	MED29	Q9NX70	200 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	SLC35F4	A4IF30	521 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	BHLHE40	O14503	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	IFNG	P01579	166 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	HMGN1	P05114	100 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ACADS	P16219	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	POU1F1	P28069	291 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	GRK5	P34947	590 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ACVR1B	P36896	505 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	CSNK1A1	P48729	337 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	SELENOP	P49908	381 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ERVK-25	P63136	954 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	MELK	Q14680	651 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	STK11	Q15831	433 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	PGGHG	Q32M88	737 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	LRRC46	Q96FV0	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	TXNDC15	Q96J42	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FANCA-231	ENST00000568626	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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