RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 NTAN1Q96AB6 310 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 MMP25Q9NPA2 562 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 COLCA2A8K830 154 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 HMSDA8MTL9 139 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 FPGTO14772 594 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 CASKO14936 926 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 OIP5O43482 229 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF44P15621 663 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 PAX6P26367 422 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 TMPRSS3P57727 454 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 E2F1Q01094 437 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ZP2Q05996 745 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 PLK5Q496M5 336 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ACSM6Q6P461 480 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 BTNL8Q6UX41 500 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 Q6ZSR9 355 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ANKRD46Q86W74 232 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SYT14Q8NB59 555 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 BBS10Q8TAM1 723 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 DPF1Q92782 380 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 TMEM203Q969S6 136 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 R3HDM4Q96D70 268 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 HBEGFQ99075 208 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 CHIAQ9BZP6 476 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 FZD3Q9NPG1 666 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 TREX1Q9NSU2 369 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 Q9Y3F1 56 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 CBY3A6NI87 242 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ZAR1LA6NP61 321 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 I6L893 689 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 PSMD3O43242 534 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SPRY2O43597 315 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC28A2O43868 658 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SC5DO75845 299 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 IFNA10P01566 189 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 IGHV2-5P01817 119 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 CEACAM5P06731 702 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ADCYAP1P18509 176 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 CNR1P21554 472 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 CDKN2DP55273 166 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 CLDN8P56748 225 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 HTR4Q13639 388 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 OR4D1Q15615 310 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC36A2Q495M3 483 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.12□□□□□ -1.43
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TSPAN3-209ENST00000560715 SPICQ8N5J4 248 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC5A8Q8N695 610 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 OR6X1Q8NH79 312 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ARL6Q9H0F7 186 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 METTL9Q9H1A3 318 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 NTMQ9P121 344 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 SCN1AP35498 2009 aa6.11□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 LRIT2A6NDA9 550 aa6.11□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 MARCH11A6NNE9 402 aa6.11□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 C5orf58C9J3I9 102 aa6.11□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.11□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 ANXA9O76027 345 aa6.11□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 LATS1O95835 1130 aa6.11□□□□□ -1.43
TSPAN3-209ENST00000560715 HCKP08631 526 aa6.11□□□□□ -1.43
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