RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PMM1	Q92871	262 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PRR25	Q96S07	402 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM72	A0PK05	275 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288		M0R3H8	397 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX3	O60493	162 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	DCTN3	O75935	186 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT33A	O76009	404 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF682	O95780	498 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NPPA	P01160	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNA14	P01570	189 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FCGR2A	P12318	317 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	POU2F1	P14859	743 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ETS2	P15036	469 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NCK1	P16333	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF17	P17021	662 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	AGA	P20933	346 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFSF4	P23510	183 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC1A3	P43003	542 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEA8	P43361	318 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	DIO1	P49895	249 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ASCL1	P50553	236 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TIRAP	P58753	221 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PSME3	P61289	254 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35A1	P78382	337 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LIPE	Q05469	1076 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	EPS8	Q12929	822 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1Q1	Q15612	314 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR7A5	Q15622	319 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPK11	Q15759	364 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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