RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SPDL1Q96EA4 605 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 LRR1Q96L50 414 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ZNF75AQ96N20 296 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 M0R233 179 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SYNGR3O43761 229 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TPST2O60704 377 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ZNF35P13682 527 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 CDH12P55289 794 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 CDH15P55291 814 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 LIPNQ5VXI9 398 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ZNF627Q7L945 461 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 C1orf159Q96HA4 380 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 FOXB1Q99853 325 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SYT3Q9BQG1 590 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 EBF4Q9BQW3 602 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 PLPP3O14495 311 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 RAB36O95755 333 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 AHCYP23526 432 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SLC6A2P23975 617 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ALDH3B1P43353 468 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 GIPRP48546 466 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 RINLQ6ZS11 566 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 C7orf26Q96N11 449 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ZNF607Q96SK3 696 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 FZR1Q9UM11 496 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 GMEB1Q9Y692 573 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ZNF726A6NNF4 738 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 C11orf98E9PRG8 122 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TCF21O43680 179 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 C8BP07358 591 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ITGA2P17301 1181 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 GPX2P18283 190 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 CSNK1A1P48729 337 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 EVX1P49640 407 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 IDH3AP50213 366 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 BIDP55957 195 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 GALK2Q01415 458 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 PXKQ7Z7A4 578 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 LRP11Q86VZ4 500 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SNX32Q86XE0 403 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SMYD1Q8NB12 490 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 HIPK4Q8NE63 616 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 M0R3H8 397 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SERPINB7O75635 380 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 MFN2O95140 757 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 TGDSO95455 350 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 HPXP02790 462 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 ADORA3P0DMS8 318 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 GLRXP35754 106 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 SEC24CP53992 1094 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 RAB1AP62820 205 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 RAB39AQ14964 217 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 FXNQ16595 210 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 CARM1Q86X55 608 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 OR5J2Q8NH18 312 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMX1-202ENST00000555574 EVPLLA8MZ36 301 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms