RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 METTL12A8MUP2 240 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TRDCB7Z8K6 153 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 F5H5P2 479 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PRRG2O14669 202 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SCRG1O75711 98 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 BCKDHAP12694 445 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TIMP2P16035 220 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GSTM3P21266 225 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 EPHA2P29317 976 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ARR3P36575 388 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CKS1BP61024 79 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H3AP68431 136 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PTSQ03393 145 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MXD1Q05195 221 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLC14A1Q13336 389 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ADIRFQ15847 76 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR2T2Q6IF00 324 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LYPD8Q6UX82 237 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 HACD2Q6Y1H2 254 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PSMF1Q92530 271 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GGACTQ9BVM4 153 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MYOTQ9UBF9 498 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 WNK3Q9BYP7 1800 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQ09 198 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GGT3PA6NGU5 568 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FAM166BA8MTA8 275 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM238C9JI98 176 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LGALS8O00214 317 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FAAHO00519 579 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS3O15072 1205 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SIX6O95475 246 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 RAB5AP20339 215 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CRHBPP24387 322 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLC6A6P31641 620 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CSF2RBP32927 897 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1C3P42330 323 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MAP2K4P45985 399 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SCD5Q86SK9 330 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A3Q96HJ5 214 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 EBF4Q9BQW3 602 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LANCL2Q9NS86 450 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CLDN24A6NM45 220 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR2C1O95371 312 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 RHCEP18577 417 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 RYKP34925 604 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 EMP1P54849 157 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ACKR1Q16570 336 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CDKN3Q16667 212 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ACSM5Q6NUN0 579 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT10Q86SR1 603 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 BVESQ8NE79 360 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR52J3Q8NH60 311 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 RNF141Q8WVD5 230 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR5P2Q8WZ92 322 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ABCG5Q9H222 651 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 WDR45Q9Y484 360 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MYH8P13535 1937 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf65A6NEN9 183 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 K7EQM0 130 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 HRO43593 1189 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SOX15O60248 233 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SEC14L2O76054 403 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLC6A11P48066 632 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CD300CQ08708 224 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms