RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 OSTF1Q92882 214 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 SLC35B4Q969S0 331 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 VMP1Q96GC9 406 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 LRR1Q96L50 414 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 SAMD8Q96LT4 415 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 DACH2Q96NX9 599 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 OPALINQ96PE5 141 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 KLHDC3Q9BQ90 382 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 ZNF559Q9BR84 538 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 ZNF649Q9BS31 505 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 ZNF426Q9BUY5 554 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 TAPBPLQ9BX59 468 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 TRIM2Q9C040 744 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 OR51E2Q9H255 320 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 OR52D1Q9H346 318 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 UBQLN3Q9H347 655 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.91□□□□□ -1.62
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TRDN-205ENST00000546248 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 HHATLQ9HCP6 504 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 FGF21Q9NSA1 209 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 PRODH2Q9UF12 536 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 CDH10Q9Y6N8 788 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 MYO9BQ13459 2157 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 LAMA3Q16787 3333 aa4.9□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 EYSQ5T1H1 3165 aa4.9□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 LRP4O75096 1905 aa4.9□□□□□ -1.62
TRDN-205ENST00000546248 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 A0A1B0GX78 115 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 FRG2CA6NGY1 282 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 EFCAB7A8K855 629 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PRYO14603 147 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ADAM10O14672 748 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TO15178 435 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SLC22A1O15245 554 aa4.9□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 CHP2O43745 196 aa4.9□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 UTS2O95399 124 aa4.9□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 HMGN1P05114 100 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 CD226Q15762 336 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 NNATQ16517 81 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 LCN10Q6JVE6 187 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RHBDD2Q6NTF9 364 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SLC30A6Q6NXT4 461 aa4.9□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 EID2Q8N6I1 236 aa4.9□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.9□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 VN1R1Q9GZP7 353 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 NUAK2Q9H093 628 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 GAREM1Q9H706 876 aa4.9□□□□□ -1.63
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