RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 DRD4P21917 467 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 GIPRP48546 466 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 UFM1P61960 85 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 LMO4P61968 165 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 MVKQ03426 396 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 RETREG3Q86VR2 466 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 RAB1CQ92928 201 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 YIPF5Q969M3 257 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 FOXB1Q99853 325 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF747Q9BV97 191 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 C1orf198Q9H425 327 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 RMND5AQ9H871 391 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 LGALS13Q9UHV8 139 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-211ENST00000528484 TGP01266 2768 aa9.9□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 C17orf100A8MU93 164 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 WNT9BO14905 357 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 BIRC5O15392 142 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 TMPRSS2O15393 492 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 PLPP2O43688 288 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 ITM2AO43736 263 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 CDC14BO60729 498 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 PRSS23O95084 383 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 IL6P05231 212 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 CBLP22681 906 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 CDKN2CP42773 168 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 SLC1A6P48664 564 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 CSNK1A1P48729 337 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 UBA52P62987 128 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 EGR4Q05215 589 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 HFEQ30201 348 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 ALKBH6Q3KRA9 238 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 AVPI1Q5T686 147 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 OGFOD2Q6N063 350 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF627Q7L945 461 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 LRP11Q86VZ4 500 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 MIER2Q8N344 545 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 SCAIQ8N9R8 606 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 C11orf40Q8WZ69 217 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 TAAR8Q969N4 342 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM19Q96HH6 336 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 GAL3ST1Q99999 423 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 EMC6Q9BV81 110 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 CDH20Q9HBT6 801 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 A0A087WUJ7 227 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 RP2O75695 350 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 SERPINI2O75830 405 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 NCR1O76036 304 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 OR6A2O95222 327 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 C1QCP02747 245 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 SERPINA5P05154 406 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 LCKP06239 509 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 HKR1P10072 659 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 ADRA2CP18825 462 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 AHCYP23526 432 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 MAGEB1P43366 347 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 CCL8P80075 99 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 SLC3A1Q07837 685 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 PUDPQ08623 228 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 RBBP4Q09028 425 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 ZP4Q12836 540 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 PMS2P3Q13401 168 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 RAB39AQ14964 217 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 FXNQ16595 210 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 TBC1D28Q2M2D7 210 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 FAM209AQ5JX71 171 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 ULK3Q6PHR2 472 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-211ENST00000528484 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.88□□□□□ -0.83
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