RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 REEP3Q6NUK4 255 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 EPGNQ6UW88 154 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC36Q8IYA8 594 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 ULBP2Q9BZM5 246 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 IKZF5Q9H5V7 419 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 LPAR2Q9HBW0 351 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF224Q9NZL3 707 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 SELENONQ9NZV5 590 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 VAPAQ9P0L0 249 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 SYNGR3O43761 229 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF35P13682 527 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 AHCYP23526 432 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 GIPRP48546 466 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 STX1BP61266 288 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 RFLNBQ8N5W9 214 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A0B4J2E0 115 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1B0GX12 115 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF726A6NNF4 738 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 C11orf98E9PRG8 122 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 M0R233 179 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 WNT9BO14905 357 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 CDH12P55289 794 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB1AP62820 205 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 PUDPQ08623 228 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 SCARB2Q14108 478 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB39AQ14964 217 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 ALKBH6Q3KRA9 238 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM91A1Q658Y4 838 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT73Q86Y46 540 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 FGFBP3Q8TAT2 258 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 EPYCQ99645 322 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXB1Q99853 325 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 EBF4Q9BQW3 602 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC167Q9P0B6 97 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 CLDND2Q8NHS1 167 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 SPDL1Q96EA4 605 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 LRR1Q96L50 414 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 OCEL1Q9H607 264 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 DUSP13Q9UII6 198 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 SPEF1Q9Y4P9 236 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM157AC9JC47 383 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 M0R3H8 397 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 PLPP3O14495 311 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB36O95755 333 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 GLRXP35754 106 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 BIDP55957 195 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 SCAIQ8N9R8 606 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 SMYD1Q8NB12 490 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 YIPF5Q969M3 257 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 ADORA3P0DMS8 318 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 NAT2P11245 290 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC6A2P23975 617 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 CSNK1A1P48729 337 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC18A1P54219 525 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 GALK2Q01415 458 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR88Q6ZMY6 472 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 SKA3Q8IX90 412 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 OR6S1Q8NH40 331 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 TLCD1Q96CP7 247 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 OR51B6Q9H340 312 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 TREM2Q9NZC2 230 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 NCR1O76036 304 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 OPN1SWP03999 348 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 EVX1P49640 407 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 IDH3AP50213 366 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 FXNQ16595 210 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF627Q7L945 461 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 PXKQ7Z7A4 578 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 ARMC8Q8IUR7 673 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF607Q96SK3 696 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 MCHR1Q99705 422 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 MS4A5Q9H3V2 200 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-205ENST00000527952 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms