RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	TSPAN11	A1L157	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		E5RJQ4	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ARPC3	O15145	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC22A2	O15244	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GYG2	O15488	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RAD51D	O75771	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	APRT	P07741	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SP1	P08047	785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT16	P08779	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	HOXB5	P09067	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	NR2F6	P10588	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	B4GALT1	P15291	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SRD5A1	P18405	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ITGAX	P20702	1163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	IGFBP5	P24593	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CRABP2	P29373	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PRDX2	P32119	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	LIPA	P38571	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CDKN2C	P42773	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PTGFR	P43088	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	IER3	P46695	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	NPBWR1	P48145	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ3	P48549	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR143	P51810	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ2	P63252	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	KLC1	Q07866	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FGL1	Q08830	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	VEZF1	Q14119	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		Q6ZPA2	131 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	EMC1	Q8N766	993 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	STMN2	Q93045	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PIGT	Q969N2	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CERS2	Q96G23	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	COQ2	Q96H96	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CPNE1	Q99829	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A0G2JND7	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1B0GTH9	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		C9JVG2	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms