RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 OR1E2P47887 323 aa13.59□□□□□ -0.23
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SH3BP2-211ENST00000506932 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa13.57□□□□□ -0.24
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SH3BP2-211ENST00000506932 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-211ENST00000506932 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-211ENST00000506932 CD5LO43866 347 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-211ENST00000506932 OR5F1O95221 314 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-211ENST00000506932 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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SH3BP2-211ENST00000506932 F13BP05160 661 aa13.55□□□□□ -0.24
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