RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 FRG2CA6NGY1 282 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 FLRT2O43155 660 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ADRB1P08588 477 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 UCHL1P09936 223 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 PER3P56645 1201 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 NTRK2Q16620 822 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 BICRALQ6AI39 1079 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TEX261Q6UWH6 196 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 COMMD7Q86VX2 200 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 OR11H7Q8NGC8 314 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 GFI1Q99684 422 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 MED28Q9H204 178 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 U3KQ87 197 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 COL6A3P12111 3177 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SHOXO15266 292 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SIGLEC5O15389 551 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZFPL1O95159 310 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 NUDT14O95848 222 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 AHCYP23526 432 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 DGCR2P98153 550 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 MESTQ5EB52 335 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 LRFN5Q96NI6 719 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD10Q9NXR5 420 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CACNG2Q9Y698 323 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 DMDP11532 3685 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 C11orf98E9PRG8 122 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TRIM77I1YAP6 450 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZNF81P51508 661 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 BTN1A1Q13410 526 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 PLA1AQ53H76 456 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 HES5Q5TA89 166 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 STPG1Q5TH74 334 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZNF767PQ75MW2 155 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 OR6V1Q8N148 313 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A36Q96CQ1 311 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CTSFQ9UBX1 484 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 MED12Q93074 2177 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SERPINA3P01011 423 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 FREM3P0C091 2139 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 IL12BP29460 328 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CLDN12P56749 244 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 DMWDQ09019 674 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ESX1Q8N693 406 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 OR1F2PQ96R84 312 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 LAT2Q9GZY6 243 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ADAM19Q9H013 955 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 RAB33BQ9H082 229 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 WDR76Q9H967 626 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 POM121CA8CG34 1229 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 DHFRP00374 187 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SRMP19623 302 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SDHAP31040 664 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 BTCP35070 178 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ISXQ2M1V0 245 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SLC36A2Q495M3 483 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 OR5M10Q6IEU7 315 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms